Очевидно, что в вопросе имеется в виду заявление о возмещении расходов на оплату услуг представителя, поданное после вынесения решения (ст. 100 ГПК РФ), так как компенсация других судебных расходов производится судом в решении (ч. 5 ст. 198 ГПК РФ) либо в дополнительном решении (п. 3 ч. 1 ст. 201 ГПК РФ).
Срока давности для подачи такого заявления закон не предусматривает. Повторная неявка ответчика в суд не предусмотрена ГПК РФ как основание для оставления без рассмотрения заявления о возмещении расходов на представителя. Если суд это сделал, то определение суда необходимо обжаловать.