Судя по содержанию вопроса, вашей задачей является возмещение вреда, причиненного чемодану, а также иных связанных с этим убытков (расходы на проезд).
В данном случае место повреждения юридического значения не имеет. Поскольку багаж был отправлен из зарубежного города, то вся перевозка является международной, в том числе, если она производилась через промежуточный пункт назначения в России.
Срок для предъявления претензии, предусмотренный ст. 127 Воздушного кодекса РФ, вами действительно пропущен. Вместе с тем это не лишает вас права требовать возмещения ущерба в судебном порядке.
Вы направили претензию и получили на нее ответ. Независимо от содержания ответа, в том числе, если он состоит в отказе рассматривать претензию по существу, вы имеет право предъявить иск к авиакомпании в суд, в том числе по месту вашего жительства.
Ваше требование вытекает из факта причинения убытков, понесенных в связи с несвоевременной доставкой багажа, и регулируется нормами Гражданского кодекса РФ (ст. 15, 793, 1064), соответственно, к вашим требованиям должен применяться общий трехлетний срок исковой давности.